1992年以前，香港的所有医疗记录都是纸质的，包括公共和私营的医疗机构在内。香港医院管理局（医管局）于1990年12月成立，负责所有公立医院的服务。在2003年，医管局接管了香港所有公立基础医疗保健诊所的管理工作。

从1993年起，医疗管理局开始进行医疗记录的数字化工作，在临床医生的参与下，他们建立了一个独特的临床管理系统（CMS），并在1995年供所有医院和医生使用，医疗管理局管理下的医院有40所，大概5000多名医生。此外，还有一个统一的患者个人数据管理系统，记录了所有到医管局求诊的患者的个人资料。

在2012年，香港特区政府启动了为所有公民建立电子健康档案的项目，以便公共和私营的医疗服务提供者能够共享病人的信息。电子健康记录平台于2014年建立并投入使用，被称为电子健康记录共享系统（eHRSS）。患者可以自愿加入这个系统，并且每次需要患者同意，医生才拥有访问权进去这个系统来看此患者的健康数据。

除了医管局外，隶属于香港中文大学的教学医院——威尔斯亲王医院也积累了过去30多年来所得到的大量病人的电子医疗保健数据。大学让一些临床医生成立和自筹资金的子公司，用这些多年积累的巨大健康信息，研究开发了可以帮助临床决策和帮助患者进行疾病管理的程式。再加上基于已经收集患者的基因组学信息，让这些公司可以开发诊断/预测慢性病风险的基因组学大数据。随着加入的患者越来越多，数据库的信息也日益增加，诊断和预测疾病的准确度也越来越高了。

在医疗保健过程中，生成的大部分数据/信息均是以结构化或者非结构化电子格式存储的，并且随着累计数量很大。

从一开始整个香港的公共医疗就只有一个统一互通的资信科技系统，避免了资信孤岛的出现。这些信息都是互通的，这个系统具有很多功能和强大的计算分析能力，广大临床医生都很喜欢使用。另外，还有很可靠的数据安全措施和管理系统来保护这个个人的隐私和数据的机密性，所以病人都不介意把自己的资料放进去。每天在公共和私营部门发生数百万次医疗交易，大部分数据都被上传到电子资讯系统的数据库，患者主索引，医疗保健数据仓库（具有大量的临床信息），政府eHRSS中包含的信息和拥有数据库的机构及教学医院成为提供医疗大数据的数据库。

在香港，这个大数据主要是用于监测正在出现的传染病，用新的大数据来帮助监测，防止有新的传染病出现。

预防慢性病，慢性病的发展轨迹以及对社会造成的负担，设计战略并制定服务计划以应对挑战。

利用老年患者的入院资料，开发了一个评分的系统，并策略性地规划和实施减少此类病患再入院的方法。 

利用大数据指导人力资本开发计划，特别是对医疗保健专业人员的培训。

用大数据为使用抗生素的方法、做法做出指导，以减少多重耐药微生物的产生和传播。

与药物处方和临床结果相关的数据结合，有助于对新研发药物进行上市后的监察工作。

来自慢性非传染性疾病患者的基因组数据，可以帮助诊断和治疗精准医学方面的疾病。

大数据加上使用神经网络技术的深度机器学习程式也有助于开发人工智能，以支持疾病的诊断和治疗。

医疗保健大数据对临床研究是丰富的资源，除卫生保健部门外，卫生大数据也可用于贫困和 老年人群的综合服务的规划和开发，例如病弱长者的长期照顾工作。

最后，医疗保健大数据将帮助政府制定年度预算和在其「五年战略计划」中确定政策重点。

 缺乏激励措施和其他因素导致私营医疗保健机构失去参与的积极性 。

公共医疗部门主管/领导人对数据安全问题的顾虑，特别是对于任何违反个人资料隐私将被追究责任的担忧，令他们不肯将大数据与学术或服务机构分享数据。

管理，维护和更新医疗保健数据库的资源要求。